Parámetros+y+variables+para+medir+la+diversidad+genética


 * (Dayon 24/10/2007) Entendiéndose esta diversidad como la diversidad dentro de una población o intrapoblacional

1. Con base en el número de variantes**

a) __Polimorfismo o tasa de polimorfismo (Pj)__ Un gen se define como polimórfico si la frecuencia de uno de sus alelos es menor o igual a 0,95 ó 0,99.

Pj=q<=0,99**
 * Pj=q<=0,95

Siendo **Pj** la tasa de polimorfismo y **q** la frecuencia alélica. Con esta medida podemos saber si un gen presenta variación, y su cálculo se hace por observación directa, viendo si se cumple o no la definición.

Este criterio de polimorfismo es totalmente arbitrario y su valor es fijado para ver en que genes es más frecuente la variación alélica.

b) __Proporción de loci polimórficos (P)__

Es el número de loci polimórficos dividido por el número total de loci (polimórficos y no polimórficos):


 * P = npj /ntotal**

Siendo **P** la proporción de loci polimórficos, **npj** el número de loci polimórficos, y **ntotal** el número total de loci. Esta expresión nos dice el número de loci variables en una población, y para su cálculo se deben contar el número de loci polimórficos y totales.

c) __Abundancia de variantes alélicas (A)__

Se refiere al número de variantes de una muestra. La medida de la diversidad es A-1, ya que en una población monomórfica la diversidad será A-1 = 0. Para un gen dado en una muestra, esta medida indica cuantas variables alélicas pueden encontrarse. Es una medida sensible al tamaño de la muestra y hay que tener en cuenta en la medida el número máximo de alelos que pueden encontrarse.

d) __Número medio de alelos por locus (n)__

Es el número de alelos contabilizados en todos los los loci, dividido por el número total de loci:


 * n = (1/K) Σ ni** (Con i desde 1 hasta K)

Siendo **K** el número de loci, y **ni** el número de locus en cada loci. Gracias a esta medida obtenemos información complementaria a la que tenemos gracias al polimorfismo. Su cálculo sólo requiere contabilizar los alelos por locus, y hacer el promedio.


 * 2. Con base en la frecuencia de variantes**

e) __Número efectivo de alelos (Ae)__

Es el número de alelos que pueden estar presentes en una población: Siendo **pi** la frecuencia de cada alelo del locus, y **h** la heterocigosidad del locus. Esta medida indica el número de alelos esperados en cada locus de una determinda población, y es la inversa de la homocigosidad de un locus.
 * Ae=1/(1-h)=1/Σpi**

f) __Heterocigosidad esperada (He) (diversidad genética de Nei)__

Es la probabilidad de que en un locus único, cualquier par de alelos escogidos al azar, sean diferentes entre sí. Se pueden realizar 3 tipos de cálculos: Siendo **hj** la heterocigosidad en cada locus, **p** y **q** las frecuencias alélicas, **H** la heterocigodad promedio para varios loci y **L** el número total de loci.
 * 1) Un locus j con 2 alelos: **hj = 1- p2 - q2**
 * 2) Un locus j con i alelos: **hj = 1 - Σ pi2**
 * 3) Promedio de varios loci: **H =** **Σ hj / L**

Esta He, si hacemos su promedio para todos los loci, obtendremos una medida de la variabilidad genética de una población. Su valor varía entre 0 y 1, y se maximiza cuando varios alelos poseen frecuencias similares.

La heterocigosidad promedio esperada para varios loci se calcula al restar 1 a las frecuencias esperadas de homocigotos de un locus, la operación se repite para todos los loci y luego se hace su promedio.